Gen ve kromozom arasındaki temel farklar şunlardır: Gen: DNA üzerinde belirli görevleri yerine getiren, belirli başlangıç ve sonlanma noktaları bulunan bölgelerdir. Belirli fiziksel özellikleri tanımlayan ve genetik bilgiyi taşıyan yapısal birimlerdir. Nükleotidlerin bir araya gelmesiyle oluşan moleküler zincirlerdir. Kromozom: DNA'nın paketlenmiş ve düzenlenmiş halidir. DNA molekülü ve proteinlerden oluşur. Hücre bölünmesi sırasında daha iyi görülebilir. Her türün kendine ait kromozom sayısı vardır ve bu sayı değişmez. Özetle, genler DNA üzerinde yer alan belirli işlevlere sahip bölgeler iken, kromozomlar DNA'nın paketlenmiş halidir ve genetik bilgiyi taşır.