Mikrobiyolojinin temel konuları şunlardır: 1. Mikroorganizmaların Sınıflandırılması: Bakteriler, virüsler, mantarlar, protozoalar ve arkealar gibi mikroorganizmaların özellikleri ve sınıflandırılması. 2. Mikrobiyolojik Büyüme ve Üreme: Mikroorganizmaların çoğalma ve üreme mekanizmaları, büyüme koşulları ve çeşitli çoğalma stratejileri. 3. Mikroorganizma Morfolojisi: Bakteri ve mantarların morfolojik özellikleri, hücre duvarı yapısı, şekil çeşitliliği ve hücre içi organeller. 4. Mikroorganizmaların Metabolizması: Mikroorganizmaların enerji üretme yöntemleri, beslenme stratejileri, anaerobik ve aerobik metabolizma. 5. Mikroorganizmaların Genetik ve Evrimi: Mikroorganizmaların genetik materyali, genetik çeşitlilik, mutasyonlar, evrimsel süreçler ve gen transferi. 6. Mikrobiyal Ekoloji: Mikroorganizmaların doğal yaşam ortamlarındaki rolü, ekosistemdeki etkileşimleri ve çeşitli ekolojik ilişkiler. 7. Mikrobiyal Hastalıklar: İnsanlarda ve diğer organizmalarda mikroorganizmaların neden olduğu hastalıklar, patojen mikroorganizmaların özellikleri ve hastalık mekanizmaları. 8. Antimikrobiyal İlaçlar ve Direnç: Antibiyotikler ve diğer antimikrobiyal ajanlar, direnç mekanizmaları, antibiyotik direncinin önlenmesi ve kontrolü. 9. Gıda Mikrobiyolojisi: Mikroorganizmaların gıda bozulması ve bozulmaya karşı koruyucu önlemler, gıda üretimi ve hijyen. 10. Endüstriyel Mikrobiyoloji: Mikroorganizmaların endüstriyel uygulamaları, biyoteknoloji, biyolojik ürünlerin üretimi ve endüstriyel süreçlerde kullanımı.