Atomlar doğada tek başına bulunmaz çünkü çoğu element, aynı cins atomların birleşmesiyle oluşan moleküller halinde bulunur. Örneğin, oksijen (O2) iki atomlu, ozon (O3) üç atomlu moleküller halinde bulunurken, hidrojen (H2) ve iyot (I2) gibi elementler de doğada iki atomlu moleküller halinde bulunur. Soygazlar ise son katmanları tam dolu olduğu için kararlı bir yapıya sahiptir ve bu nedenle doğada tek atomlu halde bulunurlar.