Pilus ve fimbria arasındaki temel farklar şunlardır: 1. Boyut ve Yapı: Pilus, fimbriadan daha uzun ve kalındır. 2. Bulundukları Bakteri Türü: Piluslar genellikle Gram-negatif bakterilerde bulunurken, fimbrialar hem Gram-pozitif hem de Gram-negatif bakterilerde görülebilir. 3. İşlev: Piluslar, genetik materyalin transferi (konjugasyon) ve hareket gibi işlevlere sahipken, fimbrialar esas olarak bakterilerin yüzeylere tutunmasını sağlar. 4. Sayı: Bir hücredeki pilus sayısı 1-10 arasında değişirken, fimbriaların sayısı 100-600 arasında olabilir.