Organeller arasındaki farklar bitki ve hayvan hücreleri bağlamında şu şekilde özetlenebilir: 1. Hücre Duvarı: Bitki hücreleri selülozdan oluşan bir hücre duvarına sahipken, hayvan hücrelerinde hücre duvarı bulunmaz; bunun yerine hücre zarı vardır. 2. Kloroplastlar: Bitki hücrelerinde fotosentez yapan kloroplastlar bulunurken, hayvan hücrelerinde bu organeller yoktur; hayvanlar besinlerini dışarıdan alırlar. 3. Büyük Vakuoller: Bitki hücrelerinde genellikle büyük ve merkezi bir vaküol bulunurken, hayvan hücrelerinde daha küçük ve sayıca fazla vaküoller bulunur. 4. Mitokondri: Her iki hücre türünde de mitokondri bulunur, ancak bitki hücrelerinde mitokondrinin işlevi, kloroplastlarla daha fazla entegre olmuştur. 5. Plastidler: Bitki hücrelerinde kloroplastların yanı sıra kromoplastlar (renkli pigmentleri depolayan) ve lökoplastlar (nişasta depolayan) gibi diğer plastid türleri de bulunur, hayvan hücrelerinde ise plastidler yoktur.