Nişasta ve glikojen, polisakkarit türleri olmalarına rağmen bazı farklılıklar gösterirler: - Yapı: Nişasta, iki glikoz molekülünün birleşmesiyle oluşurken, glikojen tek bir glikoz molekülünden oluşur. - Üretim: Nişasta bitkiler tarafından üretilirken, glikojen hayvanlar, bakteriler, arkeler ve mantarlar tarafından üretilir. - Depolama: Nişasta, bitkilerde kök, gövde, yaprak, meyve ve tohum gibi organlarda depolanır. - Suda çözünürlük: Glikojen çoğunlukla suda çözünür, nişasta ise suda az çözünür.