• Buradasın

    Moleküler kenetlenme nedir ilaç tasarımında?

    Yazeka

    Arama sonuçlarına göre oluşturuldu

    Moleküler kenetlenme (docking), ilaç tasarımında bir ligandın makromoleküle olan bağlanma enerjisini ve ligandın kovalent olmayan etkileşimler ile makromoleküle bağlandığı durumdaki konformasyonunu tahmin etmek için kullanılan bir yöntemdir 145.
    İlaç tasarımında moleküler kenetlenmenin kullanım amaçları şunlardır:
    • Reseptör bağlanma bölgesi içindeki doğal ligand pozunun tahmini 1.
    • Fizikokimyasal moleküler etkileşimlerin doğru bir şekilde tahmin edilmesi 1.
    • Büyük bileşik kütüphanelerindeki ligand moleküllerinin sanal taraması ile yeni inhibitörlerin keşfi 14.
    Moleküler kenetlenme, 1980'lerin başından beri kullanılmaktadır ve protein hedefinin üç boyutlu yapısı mevcut olduğunda tercih edilen bir araçtır 1.
    5 kaynaktan alınan bilgiyle göre:

      Yanıtı değerlendir

      5 kaynak

      1. labakademi.com
        1
      2. tr.science44.com
        2
      3. inpharmadergi.com
        3
      4. favicovir.blogspot.com
        4
      5. eksisozluk.com
        5

    Konuyla ilgili materyaller

    Lipinski'nin 5 kuralı hangi moleküller için geçerlidir?

    Lipinski'nin 5 kuralı, ağızdan alınabilen ilaçlar için geçerlidir.
    5 kaynak

    Moleküllerin birbiri ile etkileşmesi sonucu ne olur?

    Moleküllerin birbiri ile etkileşmesi sonucu çeşitli kuvvetler ortaya çıkar: 1. Kohezyon Kuvveti: Moleküllerin aynı tür diğer moleküllere çekim göstermesi, bu kuvvet sayesinde maddeler bir arada kalır. 2. Adezyon Kuvveti: Farklı tür moleküllerin birbirine yapışması, bu kuvvet sayesinde sıvılar yüzeylere tutunur. 3. Van der Waals Kuvvetleri: Moleküller arasında meydana gelen zayıf ve kısa mesafeli çekim kuvvetleri, maddelerin fiziksel özelliklerini belirler. 4. Hidrojen Bağı: Hidrojen atomunun elektronegatif elementler ile yaptığı güçlü dipol-dipol etkileşimi, suyun ve diğer bileşiklerin özelliklerini açıklar. Bu etkileşimler, maddelerin katı, sıvı veya gaz gibi farklı hallerde bulunmasını sağlar.
    5 kaynak

    Molekül nedir?

    Molekül, birbirine bağlı gruplar halindeki atomların oluşturduğu kimyasal bileşiklerin en küçük temel yapısına verilen addır. Diğer bir ifadeyle bir molekül, bir bileşiği oluşturan atomların eşit oranlarda bulunduğu en küçük birimdir. Bir molekül, aynı iki atomun bağlanması sonucu ya da farklı sayılarda farklı atomların bağlanması sonucunda oluşabilir. Molekülleri oluşturan kimyasal bağlara moleküler bağlar denir.
    5 kaynak

    Moleküler modelleme yöntemleri nelerdir?

    Moleküler modelleme yöntemleri şunlardır: Moleküler mekanik yaklaşımı: Atomların en küçük bireysel birim olarak muamele edilmesi. Kuantum kimyası yaklaşımı: Protonlar, nötronlar, kuarklar, kuarklar, gluonlar ve elektronların fotonlarıyla beraber açıkça modellenmesi. Bazı moleküler modelleme yöntemleri: Reseptör yapısına dayalı tasarım (structure based design). Ligant yapısına dayalı tasarım (ligand based design). Doking fragmana dayalı ilaç tasarımı. Farmakofor oluşturma. 3D QSAR (3 boyutlu kantitatif yapı-etki ilişkileri). CoMFA (comparative molecular field analysis). Moleküler modelleme ayrıca ilaç tasarımı, malzeme bilimi, biyokimya ve kataliz gibi birçok alanda uygulama bulur.
    5 kaynak

    Moleküller arası etkileşimler nelerdir?

    Moleküller arası etkileşimler, komşu parçacıklar (atomlar, moleküller veya iyonlar) arasında etkili olan çekim veya itme kuvvetleridir. Başlıca moleküller arası etkileşim türleri: Hidrojen bağı: Özellikle güçlü bir dipol-dipol etkileşimidir. Van der Waals kuvvetleri: Dipol-dipol etkileşimleri, dipol-indüklenmiş dipol etkileşimleri ve London kuvvetlerini içerir. İyon-dipol etkileşimleri: İyonik yapılı bir madde, polar moleküllerle karşılaştığında oluşur. Bu etkileşimler, maddelerin katı, sıvı veya gaz gibi farklı hallerde bulunmalarını sağlar.
    5 kaynak

    Moleküler simülasyon yöntemleri nelerdir?

    Moleküler simülasyon yöntemlerinden bazıları şunlardır: Lattice Boltzmann Method (LBM). Moleküler Dinamik (MD). Monte Carlo Simülasyonu. Ayrıca, INDO, ZINDO, SINDOI, PM3, AM1, CNDO, Hückel, Extended Hückel, MINDO, PRDDO, SAMI, Fense – Hall Method, PM3/TM, Gaussian Theory gibi moleküler simülasyon yöntemleri de bulunmaktadır. Moleküler simülasyon yöntemleri, kimya, biyokimya, malzeme bilimi ve ilaç tasarımı gibi birçok alanda kullanılmaktadır.
    5 kaynak

    Moleküler docking yöntemi nedir?

    Moleküler docking (kenetleme) yöntemi, bir hedef ile ligand arasındaki etkileşim enerjilerini ve bağlanma afinitelerini hesaplayarak öngören bir yöntemdir. Bu yöntem, yapıya dayalı ilaç tasarımında (SBDD) yaygın olarak kullanılır. Moleküler docking'in temel amaçları: Yapısal tanıma: Olası bağlanma modlarını bulmak. Enerji tahmini: Bağlanma afinitesini tahmin etmek. Bu yöntem, başlangıçta küçük molekül (ligand) ve hedef makromolekül (protein) arasında gerçekleştirilmek üzere tasarlanmış olsa da son yıllarda protein-protein, nükleik asit (DNA ve RNA)-ligand moleküler docking çalışmaları da yapılmaktadır. Moleküler docking için Dock, GOLD, AutoDock, rDock gibi yazılımlar kullanılır.
    5 kaynak