Mikroskobik inceleme için kullanılan temel malzemeler şunlardır: 1. Mikroskop: Işık mikroskobu, floresan mikroskobu veya elektron mikroskobu gibi çeşitli tipler kullanılır. 2. Lam ve Lamel: Cam malzemeden yapılmış, klinik örneklerin veya mikroorganizmaların incelenmesinde kullanılan malzemeler. 3. Öze: Isıyı az ileten metal bir sap ve platin veya yumuşak bir telden yapılmış, klinik örneklerin besiyerine yayılmasında kullanılan uç. 4. Eküvyon: Ucuna pamuk sarılmış tahta çubuk, örnek alma işleminde kullanılır. 5. Pipet: Cam malzemeden yapılmış, sıvı çekmeye yarayan borucuk. 6. Petri Kutusu: Steril edildikten sonra katı besiyeri dökülerek örneklerin ekilmesinde kullanılan iki parçadan oluşan cam malzeme. 7. Deney Tüpü: Değişik boy ve çaplarda, içine çeşitli klinik örnekler ve solüsyonlar konan silindir şeklindeki cam malzeme. Bu malzemeler, mikroskobik incelemelerin doğru ve etkili bir şekilde yapılmasını sağlar.