Malpighi cisimciğinin görevi, böbreklerin nefron adı verilen işlevsel birimlerinde bulunan kandan atık maddelerin süzülmesini sağlamaktır 12.

Bu süzme işlemi, kanın temizlenmesi ve idrarın oluşumu için ilk adımdır 2. Süzme işlemiyle birlikte kandan nefrona su, glikoz, amino asitler, vitamin, Na+, K+, Ca gibi mineraller, üre, amonyak, kreatin ve ürik asit geçer 2. Ancak, kan proteinleri ve hücreleri kılcal damarın içinde kalır 2.

Malpighi cisimciği, böbreklerin kanı süzerek vücudun atık maddelerden arındırılması, elektrolit ve su dengesinin sağlanması gibi hayati işlevlerinde önemli bir rol oynar 2.