İstanbul'un işgaline karşı Mustafa Kemal Paşa şu önlemleri aldı: 1. Protesto Telgrafları: İtilaf Devletleri temsilcilerine protesto telgrafları çekerek işgalin haksız gerekçelere dayandığını belirtti. 2. Meclisin Ankara'da Toplanması: Mebusan Meclisi üyelerine çağrıda bulunarak tutuklanmamış olan milletvekillerinin Ankara'da açılacak olan yeni meclise katılmalarını istedi. 3. Anadolu'daki İtilaf Subaylarının Tutuklanması: İstanbul'da İtilaf Devletleri tarafından tutuklanan subaylara karşılık, Anadolu'daki İtilaf Devletleri subaylarının tutuklanmasını istedi. 4. Gelirlerin Dondurulması: Gelirleri İstanbul'a gidecek olan kurumların bu gelirlerini dondurmalarını istedi, böylece halktan toplanan vergilerin İtilaf Devletleri tarafından kullanılmasının önüne geçilmesini amaçladı. 5. Demiryollarının Tahrip Edilmesi: Ankara'yla bağlantısı olan Geyve ve Ulukışla demiryollarını tahrip ettirerek, Ankara'ya yönelik ani bir işgal girişiminde bu yolların kullanılmasını önledi.