Çevre yönetim sistemi ve atık yönetimi arasındaki ilişki, atıkların çevreyle uyumlu bir şekilde yönetilmesini sağlamak için hazırlanan kısa ve uzun vadeli program ve politikalar olan atık yönetim planlarının, çevre yönetim sisteminin bir parçası olmasıyla kurulur. Atık yönetimi, atıkların kaynağında azaltılması, özelliğine göre ayrılması, toplanması, geçici depolanması, taşınması, geri kazanılması, bertarafı ve bertaraf işlemleri sonrası kontrolünü içerir. Çevre yönetim sistemi ise, doğal kaynakların verimli kullanımını, kirliliğin azaltılmasını ve çevrenin korunmasını sağlamak amacıyla atık yönetimi de dahil olmak üzere çeşitli çevresel süreçleri kapsayan bir yönetim yaklaşımıdır. Türkiye'de atık yönetimi, "Atık Yönetimi Yönetmeliği" ile düzenlenir.