Ali Kuşçu, matematik alanında çeşitli konularda çalışmalar yapmıştır. Öne çıkan bazı matematik konuları şunlardır: Cebir ve Denklem Çözümleri: On tabanlı sayılarla dört işlem, rasyonel ve irrasyonel sayıların kare ve küp köklerini alma, cebir (denklem çözümleri) gibi konular üzerinde çalışmıştır. Geometri: Şekil ve cisimlerin alan ve hacim formülleri, temel trigonometri formülleri gibi konular geometri kapsamında ele alınmıştır. Aritmetik: On tabanlı sayılarla işlemler, iki katını alma ve yarıya bölme, oran ve orantı kuralları gibi konular aritmetik dersinin bir parçasıdır. Ayrıca, Ali Kuşçu'nun "El-Kitab'ül-Muhtasar fi Hısab'il Cebri ve'l-Mukabele” (Cebir ve Denklem Hesabı Üzerine Özet Kitap) gibi eserleri de bulunmaktadır.