Akşemseddin, tıp alanında birkaç önemli çalışma yapmıştır: 1. "Maddetü’l-Hayat" adlı eseri, tıp alanında yazdığı en meşhur eserdir ve bir eczacılık kitabı niteliği taşır. 2. "Kitabü’t-Tıp" adlı başka bir tıp kitabını da kaleme almıştır. 3. Akşemseddin, hastalıkların teşhisini koymuş ve tedavilerini bizzat kendisi hazırlamıştır. 4. Bulaşıcı hastalıklar üzerine yaptığı çalışmalarla, hastalıkların insandan insana gözle görülmeyecek kadar küçük tohumlar aracılığıyla geçtiğini öngörerek, bu konuda ilk teorilerden birini ortaya koymuştur.