Yüksek hızlı trende inilebilecek istasyonlar, güzergaha göre değişiklik göstermektedir. Türkiye'deki bazı yüksek hızlı tren istasyonları şunlardır: İstanbul: Halkalı, Bakırköy, Söğütlüçeşme, Bostancı, Pendik. Ankara: Eryaman, Polatlı, Eskişehir, Bozüyük, Bilecik, Arifiye, İzmit. Diğer hatlar: Konya, Karaman, Sivas. Bu istasyonlar, aynı zamanda Marmaray hattı üzerinde de bulunmaktadır, bu nedenle yüksek hızlı trenlerden indikten sonra Marmaray'a aktarma yapılabilir.