Mazda CX-3'ün bazı kronik sorunları şunlardır: 1. Motor Problemleri: Dizel partikül filtresi (DPF) tıkanması, turbo gecikmesi ve yağ kaçakları gibi motor sorunları rapor edilmiştir. 2. Şanzıman Sorunları: Otomatik şanzımanda vites geçişlerinde gecikme veya sertlik, tork konvertöründe aşınma gibi problemler yaşanabilmektedir. 3. Elektrik ve Elektronik Sorunlar: Bilgi-eğlence sistemi, gösterge paneli ve farlarda arızalar, akü problemleri sıkça bildirilmiştir. 4. Süspansiyon ve Yürüyen Aksam Sorunları: Süspansiyon sistemindeki burçlar, rot başları ve amortisörlerin çabuk aşınması, direksiyon kutusunda sıvı sızıntıları gibi sorunlar mevcuttur. 5. Fren Sistemi Sorunları: Fren balatalarının ve disklerin hızlı aşınması, ABS sensörlerinde arızalar yaşanabilmektedir. 6. Paslanma ve Kaporta Sorunları: Kaporta, alt gövde ve egzoz sisteminde paslanmalar görülmektedir.