Dudak altı siğillerin nedeni genellikle Herpes Simplex Virüsü (HSV) enfeksiyonudur. Dudak altı siğillerin diğer nedenleri arasında şunlar da yer alabilir: Stres, güneş ışığına maruz kalma, hormonal değişimler ve bağışıklık sistemindeki zayıflıklar; Dudak yaralanmaları, yüksek ateş, alerji ve bazı ilaçlar; Kişisel hijyen alışkanlıkları, beslenme düzeni ve yaşam tarzı.