Otopsi ve ölü muayenesi arasındaki temel fark, inceleme yöntemlerinin ve amaçlarının farklı olmasıdır: - Ölü muayenesi, ölünün dıştan yapılan basit bir tıbbi incelemesidir ve genellikle adli tıp hekimi tarafından Cumhuriyet savcısının huzurunda gerçekleştirilir. - Otopsi ise, cesedin hem dışarıdan hem de içeriden detaylı bir şekilde incelenmesini içeren bir bilirkişi incelemesidir.