Justice League: Doom, Justice League ekibinin kontrolden çıkması durumunda oluşabilecek tehdidi konu alır. Hikayenin özeti: Vandal Savage, nüfusun üçte ikisini yok ederek yeni bir medeniyet kurmayı planlar. Savage, Cheetah, Star Sapphire, Metallo, Bane, Mirror Master ve Ma'alefa'ak'ı bir araya getirerek Adalet Birliği üyelerine karşı ölümcül saldırılar düzenlemelerini sağlar. Her bir kötü karakter, Adalet Birliği'ni alt etmek için görevini yerine getirirken, Alfred Pennyworth Batman'e, Thomas ve Martha Wayne'in mezarlarının soyulduğunu bildirir. Bane, Batman'e saldırır, onu bayıltıp babasının tabutuna gömer. Cyborg, Wonder Woman'ın zor durumunu öğrenir ve ona yardım eder. Adalet Birliği, Legion of Doom'u alt eder ancak roketin fırlatılmasını engelleyemez. Birlik, gezegeni değiştirerek roketin zararsız bir şekilde uzaklaşmasını sağlar ve Dünya'yı kurtarır. Batman, eylemlerinin potansiyel tehlikesini anladığını söyleyerek Adalet Birliği'nden ayrılır.