USB okuyucunun çalışma şekli, cihazın türüne göre değişiklik gösterebilir. Örneğin, USB parmak izi okuyucu, bir bilgisayarın kilidini açmak için herhangi bir USB bağlantı noktası veya yerleştirme istasyonuyla çalışır ve Windows 7/8/10 sistemleriyle uyumlu, tak-çalıştır bir cihaz olarak işlev görür. USB kart okuyucu ise, genellikle şu şekilde çalışır: Bağlantı: Cihaz, USB portuna takılır. Veri Aktarımı: Karttaki veriler, USB portu aracılığıyla bilgisayara aktarılır. USB okuyucunun tam çalışma şekli, cihazın modeline ve kullanım amacına bağlı olarak değişebilir.