Koko'nun zekası, çeşitli yetenekleriyle dikkat çekmektedir: İşaret dili: Koko, 1000'den fazla işareti anlayabilen ve 2000'den fazla işareti gösterebilen bir gorildir. İletişim: Kendi iletişim biçimlerini yaratmış, homurdanma ve mırlama gibi sesler çıkarmanın yanı sıra kendine özgü seslendirmeler de geliştirmiştir. Empati: "Mussolini ile Çay" filminde bir çocuğun ailesini terk ettiği sahnede duygulanmış ve empati kurabildiğini göstermiştir. Enstrüman çalma: Teyp çalmayı öğrenmiş, bu da nefesini düzenleyebildiğini kanıtlamıştır. Resim yapma: Rastgele fırça darbeleriyle resim yapabilmiş ve resimlerini yorumlayabilmiştir. Koko'nun IQ'su 70 ile 95 arasında ölçülmüştür, bu da engelli bir insandan daha yüksek, ancak sağlıklı bir bebekle eşdeğer bir seviyeye denk gelmektedir. Ancak, goril ve insan zekasının farklı şekillerde geliştiği göz önüne alındığında, bu tür karşılaştırmaların dikkatli yapılması gerektiği belirtilmektedir.