Tomodachi Game, Yuuichi Katagiri'nin yeterli paraya sahip olmamanın zorluklarını anlattığı bir hikayedir. Yuuichi, lise gezisine katılmak için para biriktirir, ancak toplanan para gizemli bir şekilde çalındığında, herkes iki arkadaşından şüphelenir. Oyun ilerledikçe, Yuuichi'nin farklı bir yüzü ortaya çıkar: acımasız, manipülatif ve düşmanlarına karşı merhametsiz olan, kuralları ve insanların özünü çözme konusunda olağanüstü bir yeteneğe sahip biri.