Muna, Gazze'de yaşayan altı yaşındaki Muna'nın hikayesini anlatıyor. Muna'nın evi, bir gece İsrailli askerler tarafından basılır ve anne-babasını kaybeder. Savaş mağduru insanlara yardım etmek için Yeryüzü Doktorları ile birlikte Gazze'ye giden cerrah Ela, Muna'ya yardım etmeye karar verir. Doktor Ali ve Gazzeli Süleyman da Muna'nın ailesini bulma sürecinde ona destek olur. Film, Filistin'de yaşanan dramı, küçük bir çocuğun gözünden anlatıyor. Muna, aynı zamanda Filistin konulu ilk Türk sinema filmi olma özelliğini taşıyor.