Endonezya'da çeşitli vahşi hayvanlar bulunmaktadır, bunlar arasında: Memeliler: aslan, kaplan, fil, su aygırı, zürafa, tilki, kurt, ayı; Sürüngenler: timsah, yarasa, Komodo ejderi; Kuşlar: cennet kuşları, erkeko, pigme tarsier. Ayrıca, Endonezya'nın adaları, devasa çiçekler ve mercan bahçeleriyle birlikte, orangutanlar ve diğer benzersiz türlere de ev sahipliği yapmaktadır.