Azerbaycan bayrağının Türkiye'de stoklanması hakkında bilgi bulunamadı. Ancak, Azerbaycan bayrağının Türkiye'de dalgalanmasıyla ilgili bazı bilgiler mevcut: Dışişleri Bakanı Ahmet Davutoğlu, Türkiye'de olması gereken her yerde Azerbaycan bayraklarının, Türk bayrağı gibi dalgalanacağını belirtmiştir. Azerbaycan bayrağı, Türk bayrağı kabul edilerek, yabancı bayrak statüsünde değerlendirilmemektedir. Azerbaycan bayrağı, kamu binalarında asılabilir, çünkü Azerbaycan, Türkiye için kardeş ve dost bir ülke olarak görülmektedir. Bununla birlikte, Türkiye'de Azerbaycan bayrağının çöp torbası olarak kullanıldığı yönünde haberler de bulunmaktadır.