Biyokütle santrallerinde yakılan atıklar şunlardır: Hayvansal atıklar: Büyükbaş, küçükbaş ve kanatlı hayvan gübreleri. Bitkisel atıklar: Patates, şeker pancarı, buğday gibi şeker ve nişasta içeren ürünler; soya, kanola, ayçiçek gibi yağlı tohumlu bitkiler; saman, dal, kabuk gibi tarımsal ve bitkisel atıklar. Orman atıkları: Ağaç dalları, kesim artıkları, yapraklar ve diğer orman ürünleri. Kentsel organik atıklar: Evsel yemek artıkları, bahçe atıkları. Endüstriyel atıklar: Kağıt ve odun işleme endüstrilerinden gelen atıklar. Ayrıca, atık su arıtma çamurları ve artık atık duruma gelen mutfak yağları da biyokütle santrallerinde kullanılabilir.