Malatya peynirinin pahalı olmasının birkaç nedeni vardır: Üretim materyali ve üretim aşamaları: Geleneksel Malatya peyniri, üreticiden üreticiye değişiklik gösteren standart dışı bir üretime sahiptir. Mevsimsel fiyat değişiklikleri: Yaz aylarında sıcakların etkisiyle üretim azalır, ancak talep artar; bu da fiyatın yükselmesine neden olur. Yüksek üretim maliyetleri: Malatya peynirinin üretiminde kullanılan çiğ inek veya koyun sütü gibi malzemelerin maliyetleri, genel üretim maliyetlerini artırmaktadır. Ayrıca, bazı satıcıların kar marjını artırma çabası da fiyatların yüksek olmasına katkıda bulunabilir.