Kruskal ve Prim algoritmaları arasındaki temel farklar şunlardır: Yaklaşım: Prim algoritması, MST'yi vertex bazında büyütür; her adımda MST'ye, içindeki bir vertex ile MST dışında bir vertex'i birleştiren en küçük ağırlıklı kenarı ekler. Kruskal algoritması, kenar bazında çalışır; kenarları artan ağırlık sırasına göre ekler ve döngü oluşturmayanları MST'ye dahil eder. Veri yapıları: Prim algoritması, en küçük ağırlıklı kenarı seçmek için genellikle bir öncelik kuyruğu (priority queue) kullanır. Kruskal algoritması, döngüleri tespit etmek için bir birlik-bul (union-find) veri yapısı kullanır. Uygun grafik türleri: Prim algoritması, yoğun grafiklerde (çok sayıda kenar) daha etkilidir. Kruskal algoritması, seyrek grafiklerde (az sayıda kenar) daha uygundur. Zaman karmaşıklığı: Prim algoritmasının zaman karmaşıklığı, kullanılan veri yapısına bağlı olarak O(E + V log V) veya O(E log V) olarak ifade edilir. Kruskal algoritmasının zaman karmaşıklığı ise kenarların sıralanması nedeniyle O(E log E) veya O(E log V) olarak belirtilir.