Zaman damgası programı kullanmak için aşağıdaki adımlar izlenir: 1. Zaman damgası istemci programı (örneğin, ZAMANE) kullanılarak zaman damgası eklemek istenen dosya seçilir. 2. Dosyanın özeti üretilir ve "Kamu SM Zaman Damgası Sunucusu"na gönderilir. 3. Zaman Damgası Sunucusu, dosyanın özeti ile zaman bilgisini birleştirip bir veri oluşturur. 4. Oluşan veri, Zaman Damgası Sunucusu'nun özel anahtarıyla imzalanır ve istemci bilgisayarına gönderilir. 5. Zaman damgası istemci programı, damgayı bilgisayara kaydeder. Zaman damgası programı kullanırken dikkat edilmesi gerekenler: Dosyanın aslı sunucuya ulaşmaz, sadece özeti gönderilir. Zaman bilgisi, atomik/uydu kaynaklarıyla senkronizedir. Zaman damgası, her türlü bilgisayar dosyası ve elektronik veri için alınabilir ve her bir zaman damgası tekil bir numaraya sahiptir. Zaman damgası programı, TÜBİTAK Kamu SM gibi zaman damgası hizmeti veren kurumlar ve lisanslı şirketlerden temin edilebilir.