Cüneyt Zapsu, Akkuyu Nükleer Santrali'nin yönetim kurulundan, şirkete açtığı dava sonrasında gelen baskılar nedeniyle istifa etmiştir. Zapsu, nükleer santrale kurulması planlanan radar sisteminin Türkiye’nin güvenlik stratejisi bakımından yaratabileceği sorunları dile getirdiği için muhalefet şerhi koymuş, ancak yönetim kurulu bu kararı almıştır. Ayrıca, IC İçtaş A.Ş.’nin sözleşmesinin feshedilip kısa süre sonra aynı şartlarda yeniden projeye dahil edilmesi, Zapsu'nun 2 milyar dolarlık bir maliyet olarak değerlendirdiği bir duruma yol açmıştır.