Zonulin testi, bağırsak geçirgenliğini değerlendirmek ve çeşitli sağlık sorunlarının teşhisinde kullanılır. Zonulin testinin yapıldığı bazı durumlar: Sızdıran bağırsak sendromu belirtileri (şişkinlik, gaz, kramp, gıda hassasiyetleri, eklem ağrıları, deri döküntüleri ve otoimmünite). Çölyak hastalığı ve gluten hassasiyeti. Gastrointestinal hastalıklar (inflamatuar bağırsak hastalıkları). Kardiyometabolik hastalıklar (tip I ve tip II diyabet, obezite). Zonulin testi, genellikle kapsamlı bir klinik değerlendirme ve diğer laboratuvar testleri ile birlikte yapılmalıdır.