Apo B ve LDL aynı değildir, ancak aralarında yakın bir ilişki vardır. Apo B, düşük yoğunluklu lipoprotein (LDL) partiküllerinin yapısında bulunan bir proteindir. LDL, kolesterolü karaciğerden vücudun diğer bölgelerine taşıyan bir lipoprotein türüdür. Bu nedenle, Apo B ölçümü, özellikle LDL partikül boyutu ve yoğunluğunun de dikkate alınması gereken durumlarda, kardiyovasküler risk değerlendirmesinde daha doğru bir gösterge olarak kabul edilmektedir.