Otoantikorlara neden olan hastalıklar, bağışıklık sisteminin vücudun kendi sağlıklı hücrelerine saldırması sonucu ortaya çıkan otoimmün hastalıklar olarak adlandırılır. Bazı otoimmün hastalıklar ve bunlara bağlı oluşan otoantikorlar şunlardır: Romatoid Artrit: Eklemlere saldıran otoantikorlar, iltihaplanmaya ve ağrıya yol açar. Lupus: Cilt, böbrekler, kalp ve akciğerler gibi birçok organı etkileyen otoantikorlar üretir. Çölyak Hastalığı: İnce bağırsağı etkileyerek besinlerin emilimini bozar. Multipl Skleroz (MS): Sinir sistemine saldırarak sinir hücrelerinin zarar görmesine neden olur. Hashimoto Tiroiditi: Tiroid bezine karşı üretilen otoantikorlar, kilo alma, halsizlik ve soğuğa karşı hassasiyet gibi belirtilere yol açar. Bu hastalıkların tanısı ve tedavisi için bir doktora başvurulması önerilir.