Mezenterit ve pannikülitin ayırıcı tanısı, genellikle görüntüleme yöntemleri ve laboratuvar testleri ile yapılır. Görüntüleme yöntemleri: Abdominal Bilgisayarlı Tomografi (BT): Mezenterik pannikülitte, mezenter kökünde yağ dokusunda heterojen kitle, damar invazyonu olmadan superior mezenterik arterin sarılması ve bağırsakların yer değiştirmesi gibi karakteristik bulgular görülür. Manyetik Rezonans Görüntüleme (MRG): MRG, inflamasyonun ön planda olduğu durumlarda mezenter yağ dokuda "kirlenme" tarzında heterojen sinyal değişiklikleri ve küçük lenf nodları gösterir. Laboratuvar Testleri: Genellikle normal veya nonspesifik sonuçlar verir. İnflamatuar sürecin ön planda olduğu durumlarda C-reaktif protein (CRP) ve eritrosit sedimantasyon hızı (ESR) yüksekliği görülebilir. Ayırıcı tanıda ayrıca retroperitoneal ve mezenterik lenfoma, karsinoid tümör, akut pankreatit ve portal ven trombozu gibi durumlar da göz önünde bulundurulmalıdır. Doğru tanı için biyopsi veya cerrahi müdahale genellikle gerekli değildir.