Kadın ve erkek cinsel organlarının farklı olmasının temel nedeni, üreme süreçlerindeki rollerinin farklı olmasıdır. Erkekler: Sperm üretimi ve bu spermlerin kadın üreme sistemine iletilmesi gibi daha sınırlı bir üreme işlevine sahiptir. Kadınlar: Yumurta üretimi, döllenme, gebeliğin devamı ve fetüsün doğumu gibi daha karmaşık bir üreme sürecine dahildir. Ayrıca, kadın ve erkek cinsel organlarındaki farklılıklar şu şekilde özetlenebilir: Penis ve klitoris: Erkeklerde penis, kadınlarda ise klitoris bulunur. Vesibüler bulbuslar ve korpus spongiosum: Penisteki korpus spongiosumun karşılığı, kadınlarda labia minorlerdeki erektil doku olan vesibüler bulbuslardır. Overler ve testisler: Kadınlardaki overlerin karşılığı, erkeklerde testislerdir. Bartolin bezleri ve bulbo üretral bezler: Kadın anatomisinde Bartolin bezleri, erkek anatomisinde ise bulbo üretral bezler (Cowper) bulunur. Arteriyel dolaşım: Erkeklerde penis, kadınlarda ise klitoris hipogastrik arterin bir dalı olan internal pudental arter tarafından kanlanır.