Jinekoloji ve onkoloji arasındaki temel fark, jinekolojinin kadın üreme sağlığı ve hastalıklarıyla, onkolojinin ise kanserlerin tanı, tedavi ve takibiyle ilgilenmesidir. Jinekoloji onkoloji, kadın üreme organlarında (rahim, yumurtalık, serviks, vajina, vulva) görülen kanserlerin tanı, tedavi ve takibini kapsayan bir tıp dalıdır. Jinekoloji uzmanları ise kadın sağlığı, gebelik, doğum ve üreme sistemiyle ilgili genel hastalıkların tanı ve tedavisinde uzmanlaşmıştır. Jinekolojik onkoloji uzmanları, kanserlerin erken teşhisi için tarama testleri uygular ve kanserin evresine göre cerrahi, kemoterapi veya radyoterapi gibi tedavi yöntemlerini planlar.