Hidroterapi, çeşitli hastalıkların tedavisinde destekleyici olarak kullanılabilir. İşte bazı örnekler: Kas-iskelet sistemi hastalıkları: Osteoartrit, romatoid artrit, fibromiyalji, bel ve boyun fıtığı gibi durumlarda ağrıyı azaltır, eklem hareket açıklığını artırır ve kas gücünü korur. Nörolojik hastalıklar: Felç (inme), serebral palsi, multipl skleroz (MS) ve Parkinson hastalığı gibi durumlarda denge ve koordinasyonu geliştirir, kas tonusunu düzenler ve fonksiyonel bağımsızlığı artırır. Ortopedik rehabilitasyon ve travmalar: Kırıklar, bağ yaralanmaları ve cerrahi sonrası iyileşme süreçlerinde fonksiyonel iyileşmeyi destekler ve toparlanma sürecini hızlandırır. Kronik ağrı sendromları: Bel ve boyun ağrıları, miyofasiyal ağrı sendromu ve postüral bozukluklara bağlı ağrılarda kas gevşemesi ve dolaşımın artması sağlanır. Solunum sistemi hastalıkları: Astım ve bronşit gibi hastalıklarda su içinde yapılan nefes egzersizleri ile solunum kasları güçlenir ve solunum kapasitesi artar. Hidroterapi uygulaması, fizyoterapist veya ilgili uzman tarafından kişiye özel olarak tasarlanmalı ve uygulanmalıdır.