Heparin kullanımı, bazı durumlarda kontrendikedir. Heparin kullanımı için kontrendikasyonlar şunlardır: Aşırı duyarlılık: Heparin, domuz kaynaklı maddeler veya ilacın içeriğindeki yardımcı maddelere karşı aşırı duyarlılığı olan kişilerde kullanılmamalıdır. Kanama eğilimi: Hemofili, beyin kanaması gibi kanama eğilimi olan hastalarda dikkatli olunmalıdır. Ciddi karaciğer hastalığı: Şiddetli karaciğer hastalığı bulunan hastalarda heparin kullanımı kontrendikedir. Aktif kanama: Aktif kanaması olan veya diğer kanama hastalığı bulunan hastalarda kullanılmamalıdır. Prematüre bebekler ve yeni doğanlar: Benzil alkol içerdiğinden, bu grup hastalarda kullanılmamalıdır. Bazı tıbbi durumlar: Özofagus varisleri, şiddetli hipertansiyon, aktif tüberküloz ve aşırı kılcal damar geçirgenliği gibi durumlarda heparin kullanımı kontrendikedir. Heparin kullanmadan önce, olası kontrendikasyonları ve riskleri değerlendirmek için bir sağlık uzmanına danışılmalıdır.