Bazı organlar, çeşitli nedenlerle nakil edilemez: 1. Beyin: Beyin nakli, tıbbi teknoloji ve bilginin yetersizliği nedeniyle mümkün değildir. 2. Omurilik: Omurilik nakli, hasar veya kesi durumunda hareket kabiliyeti ve diğer temel fonksiyonları ciddi şekilde etkilediği için yapılamaz. 3. Mide ve Bağırsaklar: Teknik olarak nakil edilebilirler ancak mide yaşamak için çok gerekli bir organ olmadığı ve nakil sonrası problemlerin sık görülmesi nedeniyle tercih edilmezler. 4. Safra Kesesi: Teknik olarak yapılabilmesine rağmen, apandisit gibi gerekli olmayan bir organ olarak değerlendirildiğinden nakille uğraşılmaz. Diğer organlar arasında kalp kapakçıkları ve retina da nakil edilemeyen organlar arasındadır.