Crigler-Najjar sendromu, uridin difosfoglukuronat glukuronosiltransferaz (UGT1A1) genindeki anormallikler nedeniyle ortaya çıkar. Crigler-Najjar sendromunun iki türü vardır: Tip 1 (CN1): Enzim işlevi tamamen yoktur. Tip 2 (CN2): Enzim işlevi normalin %20'sinden azdır. Bu durum, otozomal resesif bir şekilde kalıtsaldır, yani bireyin etkilenmesi için her iki biyolojik ebeveynden de mutasyona uğramış genin bir kopyasını alması gerekir.