Çocuklarda MR çekimi şu adımlarla gerçekleştirilir: 1. Hazırlık: Çekimden önce çocuğun üzerindeki metal cisimler çıkarılmalıdır (gözlük, bilezik, küpe, kemer vb.). 2. Açlık: Çekim öncesi 6 saat açlık istenir. 3. Anestezi: Çocuğun hareketsiz durması zor olduğundan, gerekli durumlarda hafif bir sakinleştirici anestezi uygulanır. 4. İşlem: Çocuk, halka şeklindeki dev bir mıknatısın içindeki yatağa yatırılır. 5. Sesler: Çekim sırasında makineden yüksek sesler gelecektir, bu yüzden çocuğa önceden bilgi verilmelidir. 6. Süre: Çekim, taranan alanın boyutuna ve çekilen görüntü sayısına bağlı olarak 15 ila 90 dakika sürer. 7. Sonrası: Anestezi kullanılmadıysa, çocuk hemen normal hayatına dönebilir; sakinleştirici kullanılıyorsa, aracın kullanılmaması ve ilacın etkilerinin tamamen geçmesi beklenmelidir.