Cerrahi onkoloji, neredeyse tüm kanser türlerinde tedavi amaçlı kullanılabilir. Yaygın olarak cerrahi onkolojinin tedavi ettiği kanser türleri şunlardır: Meme kanseri: Erken evre meme kanserlerinde tümörün tamamıyla çıkarılması sıklıkla uygulanır. Kolon kanseri: Kalın bağırsak kanserlerinde tümörlü bölgenin çıkarılması ve bağırsakların birleştirilmesi işlemi gerçekleştirilir. Rektum kanseri: Rektum kanserlerinde bazen yapay bir anüs oluşturulması gerekebilir. Mide kanseri: Midenin tümünün veya bir kısmının çıkarılması işlemi uygulanır. Pankreas kanseri: Erken evrelerde cerrahi tedavi mümkündür, ancak genellikle ileri evrede teşhis edildiğinden cerrahi zor olabilir. Karaciğer kanseri: Karaciğer tümörlerinin cerrahi olarak çıkarılması, karaciğer nakli gibi yöntemlerle tedavi edilebilir. Tedavi yöntemi, kanserin evresi, tümörün büyüklüğü ve bulunduğu yer gibi faktörlere bağlı olarak belirlenir.