Canan Karatay'ın en iyi kitabının hangisi olduğuna dair kesin bir yanıt vermek mümkün değildir, çünkü bu, kişisel tercihlere bağlıdır. Ancak, Canan Karatay'ın en bilinen ve popüler kitapları arasında şunlar yer alır: Karatay Diyeti; Karatay Diyeti'yle Yaşam Boyu Sağlık; Karatay Mutfağı; Karatay Diyetiyle Obezite ve Diyabete Çözüm Var; Karatay Diyetiyle Beslenme Tuzaklarından Kurtuluş Rehberi. Ayrıca, Anne Adayları ve Hamileler İçin Karatay Diyeti kitabı da dikkat çeken eserleri arasındadır.