Aile hekimliği mesai denetimi, Aile Hekimliği Uygulama Yönetmeliği ve Aile Hekimliği Ödeme ve Sözleşme Yönetmeliği'ne göre gerçekleştirilir. Denetimler şu şekilde yapılır: Periyodik denetimler: Aile sağlığı merkezleri, aile hekimleri ve aile sağlığı elemanları, olağan dışı denetimler hariç olmak üzere, altı aylık aralıklarla denetlenir. Denetim ekipleri: Denetimler, Kurum (Türkiye Halk Sağlığı Kurumu), ilgili mülki idare amirleri (Vali/Kaymakam) veya yerel sağlık idare amirleri (İstanbul Halk Sağlığı Müdürlüğü) tarafından görevlendirilen ekipler tarafından yapılır. Denetim formları: Denetimler, Kurum tarafından belirlenen denetim formları ile gerçekleştirilir. Aykırılık tespiti: Mevzuat veya sözleşme şartlarına aykırılık tespit edilirse, ilgili yönetmelik çerçevesinde işlem yapılır. Olağan dışı denetimler, belirli bir durumun veya şikayetin ortaya çıkması halinde yapılır ve bu denetimlerde özel bir form kullanılır.