Alfa 159 motorunun sorunlu olmasının bazı nedenleri: 1.9 JTD dizel motor: Bu motor, enjektör arızaları, turbo sorunları ve DPF (Dizel Partikül Filtresi) tıkanıklığı gibi kronik sorunlar yaşayabilir. Karbon birikimi: Direkt enjeksiyonlu JTS motorlarda zamanla emme subaplarında karbon birikimi oluşur, bu da tekleme, çekiş kaybı ve rölanti dalgalanması gibi sorunlara yol açar. Motor teklemesi: 1.9 JTDM motorlarda, 2000 devir civarında "jik jik" diye tabir edilen, dönen bir yere sürten kayış sesi ve silkeleme sorunu yaşanır. Ayrıca, 2.4 JTD versiyonlarında torkun yüksek olması nedeniyle çift kütleli volan sistemleri daha çabuk yıpranır ve debriyajda titreme, kavrama zorluğu ve sesli çalışma gibi sorunlara yol açar. Alfa 159 satın almadan önce, aracın geçmişini dikkatlice kontrol ettirmek ve güvenilir bir tamirciye kapsamlı bir inceleme yaptırmak önerilir.