Zeugma Mozaik Müzesi'nin planı şu şekilde özetlenebilir: 1. Yapı Grupları: Müze, 3 adet yapı grubundan oluşur: sergi ve konferans salonu binası, idari birimler. 2. Oturum Alanı: Toplam oturum alanı 30.000 m²'dir. 3. Sergileme Projesi: Müzenin projelendirilmesi, Zeugma'nın sanatsal, kültürel yönü ve günlük yaşamın detayları üzerine kurgulanmıştır. 4. Sergileme Bölümleri: - Bodrum Kat: Hamam mozaikleri. - Giriş Kat: Fırat kenarındaki villalarda bulunan mozaikler (Poseidon ve Euphrates villaları, Dionysos villası mozaikleri). - 1. Kat: ZAP 2000 kurtarma kazıları sonucu bulunan mozaikler, Gaziantep çevresinde bulunarak müzeye getirilen geç antik dönem kilise mozaikleri. 5. Özel Alanlar: Gezi güzergahında bulunan kiosklar, dokunmatik ekranlar aracılığıyla mozaiklerin tarihçesi, kazı alanı ve müze içindeki konumları hakkında bilgi sunar.