Samurai X, diğer adıyla Rurouni Kenshin, Himura Kenshin'in hikayesini anlatır 34.

Kenshin, Meiji Devrimi sırasında devrimciler için birçok adam öldürmüş ve bu yüzden Hitokiri Battousai adını almış usta bir suikastçıdır 34. Devrim bittikten sonra bir daha asla öldürmeyeceğine yemin eder ve bir rurouni (gezgin) olarak seyahat etmeye başlar 34.

Seyahati sırasında yanlış bir anlaşılma nedeniyle Kaoru Kamiya ile tanışır ve Kaoruya babasından kalan dojo'da geçici olarak yaşamaya başlar 34. Kenshin, geçmişinin onu asla bırakmayacağını ve nerede olursa olsun, nereye giderse gitsin hep onu takip edip bir gün intikam alacağını bilir 3.

Ayrıca, Samurai X: Reflection adlı anime, serinin sonrasını anlatır 2. Kenshin ve Kaoru evlenmiş ve bir çocuk sahibi olmuşlardır 2. Ancak Kenshin, geçmişinden kurtulamaz; öldürdüğü insanların hayaletleri onu rahat bırakmaz ve vücudu da iflas etmiştir 2. Ölümcül bir hastalığa yakalanan Kenshin, son bir iş için Çin’e gider ve orada eski bir düşmanıyla karşılaşır 2. Kaoru ise onu bekler, ancak Kenshin geri dönmez 2. Kaoru da onun ardından ölür 2. Anime, bu iki karakterin son anlarını anlatır 2.