Özbeklerin kökeni, Orta Asya'daki en eski halklara dayanmaktadır. Özbeklerin atalarının ortaya çıkışı, Moğolistan Hanı Cengiz Han'ın en büyük oğlu Cuci'nin dönemine kadar uzanır. Ayrıca, Özbeklerin etnik kimliğinin oluşmasında, Karahanlılar Devleti ve XIV-XVI. yüzyıllarda Deşti Kıpçak'tan gelen Türk ve Türkleşmiş Moğolların Maveraünnehr'e siyasi intikali de önemli rol oynamıştır.