Amasya Genelgesi ve Erzurum Kongresi arasındaki bazı farklar şunlardır: Toplanma Amacı: Amasya Genelgesi, milli mücadelenin gerekçesini, yöntemini ve amacını belirlerken; Erzurum Kongresi, ulusal güçleri birleştirmek ve milli hareketi idare edebilecek bir teşkilat kurmak amacıyla toplanmıştır. Kararların Kapsamı: Erzurum Kongresi'nde alınan kararlar bölgesel iken, Amasya Genelgesi'nin etkileri ulusal düzeyde olmuştur. Temsil Heyeti: Erzurum Kongresi'nde 9 kişiden oluşan Heyet-i Temsiliye kurulmuş, Sivas Kongresi'nde ise bu sayı 16'ya çıkarılmış ve yetki alanı Anadolu ve Rumeli'yi kapsayacak şekilde genişletilmiştir. Yeni Devlet Kurma Düşüncesi: Amasya Genelgesi'nde milli egemenliğe dayalı yeni bir devlet kurma düşüncesinden bahsedilirken, Erzurum Kongresi'nde milli egemenliğe dayalı yeni bir devlet kurma düşüncesi ilk kez oluşmuştur. Alternatif Hükümet: Erzurum Kongresi'nde, mevcut hükümetin bağımsızlığı sağlayamaması durumunda geçici bir hükümetin kurulması kararlaştırılmıştır. Manda ve Himaye: Manda ve himaye, ilk kez Erzurum Kongresi'nde reddedilmiş, Sivas Kongresi'nde ise kesin olarak reddedilmiştir.