Sağlık Bakanlığı denetimlerini Denetim ve Değerlendirme Dairesi Başkanlığı yürütmektedir. Ayrıca, Sağlık Bakanlığı, sağlık hizmeti veren kurum ve kuruluşların denetimini doğrudan kendisi de gerçekleştirebilir. Sağlık Bakanlığı, gerektiğinde bağlı kuruluşların ve denetime tabi diğer kurum ve kuruluşların denetimini yapmak için Denetim Hizmetleri Başkanlığı'nı da kullanabilir.