Ticari radyofarmasötikler, spesifik fizikokimyasal ve radyasyon özelliklerine bağlı olarak iki ana sınıfa ayrılır: 1. Teşhis amaçlı radyofarmasötikler: Gama (γ) veya pozitron (β+) yayan radyonüklidlerle hazırlanır. 2. Tedavi amaçlı radyofarmasötikler: Beta (β-) veya alfa (α) partiküler radyasyon yayan radyonüklidlerle hazırlanır. Ayrıca, radyofarmasötikler uygulama yollarına göre de sınıflandırılabilir: Gazlar: Kripton-85 (85Kr), Ksenon-133 (133Xe). Çözeltiler: İyot-131 sodyum iyodür çözeltisi (131I), 99mTeknesyum-dietilen triamin penta asetik asit (99mTc-DTPA). Kapsüller: 131 I-sodyum iyodür, 198Au, 192Ir veya 125I. Kolloidler ve süspansiyonlar: 99mTc sülfür kolloit (99mTc-SC), 99mTc MAA. Radyofarmasötikler, ayrıca kullanım öncesi hazırlık süreçlerine göre de sınıflandırılabilir: Kullanıma hazır radyofarmasötikler. Yarı hazır ürünlerden elde edilen radyofarmasötikler. Kullanım öncesi doğrudan hazırlanan radyofarmasötikler. Hastadan alınan örneklere dayanan radyofarmasötikler (otolog işaretli ürünler).